Opa Rafa! Que massa que conseguiu achar o que procurava!!

Cara, esse erro é pq vc emitiu muitos certificados no LetsEncrypt num dia e atingiu o limite deles.

Pode ser que vc tenha derrubado os containers e subido muitas vezes, assim a cada vez que ele subia de novo, tentava emitir um novo certificado.

Sobre a dúvida da aplicação, se sua aplicação estiver escutando na porta 8080, basta vc fazer expose da porta 8080 e configurar o VIRTUAL_HOST no container da aplicação que o nginx-proxy já deve mapear automaticamente sua aplicação no domínio especificado.